Alături de capelă, biblioteca reprezintă al doilea punct esenţial al casei. Cuprinzând un număr de aproximativ 45.000 de volume, majoritatea în limbile italiană, germană, franceză şi română, fondul de carte al bibliotecii Institutului Teologic acoperă toate domeniile teologice şi umaniste. Printre comorile ei se numără o serie de cărţi vechi şi de valoare, cum ar fi unele tratate de teologie editate la începutul secolului al XVII-lea, şi anumite colecţii importante ca Sources Chrétiennes, Migne, Grande Antologia Filosofica (31 volume).

Biblioteca este organizată pe domenii de specialitate şi momentan este parţial informatizată. În structurile sale intră şi un depozit de carte veche şi o sală de lectură unde studenţii pot consulta diferite dicţionare, enciclopedii, reviste şi periodice.
Biblioteca îşi propune ca pe viitor să poată oferi utilizatorilor de Internet un catalog on-line cu toate titlurile disponibile şi să stabilească raporturi cu alte biblioteci din ţară şi din străinătate.